Organizacijska struktura diktira kako zaposlenici i menadžment komuniciraju unutar agencije. Baš kao što tvrtke u privatnom sektoru koriste svoje organizacijske strukture kako bi ostvarile svoje ciljeve produktivnosti i profitabilnosti, agencije u javnom sektoru zapošljavaju organizacijsku strukturu kako bi ispunile svoje zadaće za dobrobit svih građana. Agencije javnog sektora se oslanjaju na strogo definiranje uloga unutar organizacijske strukture kako bi izvršile svoje misije.
Vertikalna struktura
Većina vladinih agencija na svim razinama koristi vertikalnu strukturu.Vertikalne organizacijske strukture definiraju se voditeljem ili voditeljem odjela na vrhu, s brojem srednjih menadžera i još nižim pozicijama. Voditelji odjela diktiraju operativne postupke, srednji menadžeri kreiraju planove za provedbu tih postupaka, a radnici na nižim razinama obavljaju potrebne zadatke. Dok su razne grane vojne službe glavni primjeri vertikalne strukture, mnoge civilne agencije također koriste tu metodu.
Horizontalna struktura
Dok se vertikalna struktura fokusira na hijerarhiju, horizontalna struktura koristi jednaku postavku. Horizontalna struktura koristi manje slojeva između upravljanja i rada i omogućuje otvoreniju komunikaciju između tih slojeva. Iako se rijetko viđa na najvišim razinama vlasti, horizontalna se struktura često koristi u agencijama s manjim jurisdikcijama, nižim proračunima i manje zaposlenika. Na primjer, direktor lokalnog odjela za zdravstvo može koristiti horizontalnu strukturu kako bi izravno komunicirao s inspektorima i drugim zaposlenicima, umjesto da koristi srednjeg menadžera.
Struktura divizije
Strukture odjela razdvajaju zaposlenike po zanimanju ili geografiji. Svaki odjel nadzire vlastite operacije uz minimalan doprinos drugih odjela. Na primjer, na saveznoj razini, State Department rješava vanjske poslove. Unutar State Departmenta nalaze se odjeli koji se bave poslovima vezanim za gospodarski rast, politička pitanja, kontrolu naoružanja i ljudska prava.
Matrična struktura
Matrica organizacijske strukture koristi sustav u kojem se odnosi između zaposlenika i menadžmenta uspostavljaju kao mreža - ili matrica - umjesto u konvencionalnoj hijerarhiji. Struktura matrice dopušta agencijama preklapanje dužnosti da komuniciraju jedna s drugom, ali također može dovesti do dupliciranja napora. Na primjer, Uprava za znanost i tehnologiju, odjel Ministarstva domovinske sigurnosti, koristi strukturu matrice za koordinaciju svojih napora u borbi protiv terorizma.